Partiets højeste styrende organ er årsmødet. Partiet ledes mellem årsmøderne af hovedbestyrelsen.
Medlemmerne af Feministisk Initiativs hovedbestyrelse er:
- Siri Andersen
- Liv i Dali
- Ida Damgaard
- Cathrine Borum Hyldig
- Charlotte Maybom
- Channa Ortmark
- Muneeza Rosendahl
- Martin Spangsbro-Pedersen
- Andreas Bergmann Steen
Partisekretær: Siri Andersen
Feministisk Initiativ baserer sig på en flad organisationsstruktur, derfor har vi ikke en forperson, men to talspersoner:
